В 2013 году, после сообщения о возможных нарушениях в Рижском свободном порту, полученного от Государственного контроля, сотрудники Управления по борьбе с экономическими преступлениями начали уголовный процесс, или так называемое «Дело Рижского свободного порта».
В ходе расследования летом этого года было установлено, что два должностных лица Свободного порта, возможно умышленно, использовали своё служебное положение с целью наживы. В связи с этим стражи порядка начали отдельный уголовный процесс.
Подозреваемыми были признаны двое мужчин. В октябре материалы дела сотрудники полиции передали в прокуратуру, занимающуюся расследованием финансовых и экономических преступлений, для уголовного преследования.
По имеющейся в распоряжении агентства BNS неофициальной информации, подозреваемыми являются многолетний управляющий Рижского свободного порта Леонид Логинов и его заместитель Айгарс Печакс.
На данный момент расследование основного так называемого «Дела Рижского свободного порта» продолжается по XIX и XXIV разделам Уголовного закона.